Κατά τον καθαρισμό, θα πρέπει να χρησιμοποιούνται ειδικά καθαριστικά και μαλακό πανί για να σκουπίζονται απαλά οι οπές του πλέγματος του κυλίνδρου anilox, ώστε να αποτρέπεται η πρόκληση ζημιάς στην ευαίσθητη δομή του από σκληρά αντικείμενα. Η αφαίρεση σκόνης από την επιφάνεια του σώματος του μηχανήματος, τις ράγες οδήγησης και τις θύρες απαγωγής θερμότητας του σερβοκινητήρα είναι επίσης κρίσιμη για να διασφαλίζεται η ομαλή απαγωγή θερμότητας και η σταθερή μηχανική κίνηση. Η συντήρηση της λίπανσης πρέπει να ακολουθεί αυστηρά τις προδιαγραφές του εξοπλισμού και να προστίθεται τακτικά το καθορισμένο γράσο στις ράγες οδήγησης, τα ρουλεμάν και άλλα εξαρτήματα για τη μείωση της απώλειας τριβής και τη διατήρηση της μακροπρόθεσμης ακρίβειας της φλεξογραφικής μηχανής εκτύπωσης. Επιπλέον, οι καθημερινές επιθεωρήσεις της στεγανοποίησης των πνευματικών αγωγών και της συσσώρευσης σκόνης στα ηλεκτρικά ερμάρια μπορούν να αποτρέψουν αποτελεσματικά τις ξαφνικές βλάβες.

Η σταθερότητα του συστήματος της φλεξογραφικής μηχανής εκτύπωσης εξαρτάται από τη διπλή συντήρηση υλικού και λογισμικού. Παρόλο που η δομή μετάδοσης χωρίς γρανάζια απλοποιεί τη μηχανική πολυπλοκότητα, εξακολουθεί να είναι απαραίτητο να ελέγχεται τακτικά η στεγανότητα του σερβοκινητήρα και η τάση του σύγχρονου ιμάντα για να αποφευχθεί η χαλαρότητα και η απόκλιση καταγραφής. Όσον αφορά το σύστημα ελέγχου, είναι απαραίτητο να παρακολουθούνται οι παράμετροι της σερβοκίνησης σε πραγματικό χρόνο και να βαθμονομείται το σύστημα καταγραφής. Η ευαισθησία του αισθητήρα τάσης και της συσκευής προσρόφησης κενού επηρεάζει άμεσα τη μετάδοση του υλικού και ο καθημερινός καθαρισμός και οι λειτουργικοί έλεγχοι είναι απαραίτητοι. Κατά τη μακροχρόνια χρήση, η διαχείριση των αναλώσιμων του φλεξογραφικού εκτυπωτή είναι εξίσου σημαντική, όπως η έγκαιρη αντικατάσταση των λεπίδων ξύστρας και των σωλήνων μελάνης γήρανσης και η τακτική δημιουργία αντιγράφων ασφαλείας των παραμέτρων του εξοπλισμού για την αντιμετώπιση ανωμαλιών δεδομένων. Ο έλεγχος της θερμοκρασίας και της υγρασίας του περιβάλλοντος του εργαστηρίου μπορεί να μειώσει την παραμόρφωση του υλικού και τις ηλεκτροστατικές παρεμβολές και να βελτιστοποιήσει περαιτέρω το αποτέλεσμα της εκτύπωσης. Μόνο μέσω επιστημονικών και συστηματικών στρατηγικών συντήρησης μπορούν οι φλεξογραφικές εκτυπωτικές μηχανές να συνεχίσουν να αξιοποιούν τα πλεονεκτήματά τους της υψηλής ακρίβειας και της υψηλής απόδοσης, διατηρώντας παράλληλα τις προσπάθειες για τη διευκόλυνση της βελτιστοποίησης της δομής και της τεχνολογικής προόδου στο βιομηχανικό οικοσύστημα εκτύπωσης-συσκευασίας.